Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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