Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LSAMPQ13449 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms