Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2V1Q13404 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms