Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3BQ13214 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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