Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RESTQ13127 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RESTQ13127 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RESTQ13127 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RESTQ13127 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RESTQ13127 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RESTQ13127 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RESTQ13127 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RESTQ13127 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RESTQ13127 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RESTQ13127 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RESTQ13127 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RESTQ13127 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RESTQ13127 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RESTQ13127 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RESTQ13127 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RESTQ13127 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RESTQ13127 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RESTQ13127 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RESTQ13127 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RESTQ13127 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RESTQ13127 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RESTQ13127 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RESTQ13127 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RESTQ13127 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RESTQ13127 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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