Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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