Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH17Q12864 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CDH17Q12864 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CDH17Q12864 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CDH17Q12864 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CDH17Q12864 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CDH17Q12864 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CDH17Q12864 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CDH17Q12864 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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CDH17Q12864 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH17Q12864 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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