Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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