Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RAB40BQ12829 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RAB40BQ12829 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RAB40BQ12829 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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