Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCB1Q12824 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCB1Q12824 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCB1Q12824 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCB1Q12824 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCB1Q12824 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCB1Q12824 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCB1Q12824 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCB1Q12824 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCB1Q12824 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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