Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXM1Q08050 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXM1Q08050 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms