Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms