Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNG1Q06432 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms