Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN12Q05209 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms