Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms