Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms