Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms