Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUCB1Q02818 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms