Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms