Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHDQ02161 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHDQ02161 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHDQ02161 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHDQ02161 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RHDQ02161 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHDQ02161 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHDQ02161 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHDQ02161 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHDQ02161 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RHDQ02161 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHDQ02161 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHDQ02161 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHDQ02161 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHDQ02161 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHDQ02161 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHDQ02161 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHDQ02161 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms