Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT85P78386 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT85P78386 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT85P78386 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT85P78386 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT85P78386 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT85P78386 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms