Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HBBP68871 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HBBP68871 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HBBP68871 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HBBP68871 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HBBP68871 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HBBP68871 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HBBP68871 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HBBP68871 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HBBP68871 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms