Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY3P57055 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms