Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH8P55286 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH8P55286 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH8P55286 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH8P55286 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH8P55286 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH8P55286 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH8P55286 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH8P55286 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH8P55286 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH8P55286 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms