Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC2P49815 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC2P49815 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC2P49815 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC2P49815 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC2P49815 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC2P49815 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC2P49815 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC2P49815 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC2P49815 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC2P49815 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSC2P49815 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TSC2P49815 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC2P49815 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC2P49815 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC2P49815 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC2P49815 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms