Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTAP49354 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNTAP49354 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNTAP49354 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FNTAP49354 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNTAP49354 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNTAP49354 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms