Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTDSS1P48651 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms