Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN1S1P47710 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN1S1P47710 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms