Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT3P45378 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms