Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL4P36578 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL4P36578 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL4P36578 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL4P36578 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL4P36578 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL4P36578 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 620 ms