Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA5P31644 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA5P31644 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms