Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD34P28906 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD34P28906 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD34P28906 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD34P28906 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD34P28906 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD34P28906 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms