Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGA6P23229 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA6P23229 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms