Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA1P20827 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms