Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms