Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF4P18848 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF4P18848 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF4P18848 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF4P18848 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF4P18848 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF4P18848 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF4P18848 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATF4P18848 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATF4P18848 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATF4P18848 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATF4P18848 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATF4P18848 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATF4P18848 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATF4P18848 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATF4P18848 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATF4P18848 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATF4P18848 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATF4P18848 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATF4P18848 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms