Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DESP17661 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DESP17661 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DESP17661 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DESP17661 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DESP17661 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DESP17661 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DESP17661 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DESP17661 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms