Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARGP13631 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARGP13631 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARGP13631 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RARGP13631 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RARGP13631 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RARGP13631 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RARGP13631 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RARGP13631 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARGP13631 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms