Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG2P13521 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG2P13521 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG2P13521 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG2P13521 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG2P13521 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG2P13521 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG2P13521 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG2P13521 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG2P13521 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG2P13521 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCG2P13521 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCG2P13521 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCG2P13521 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCG2P13521 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCG2P13521 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG2P13521 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms