Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MS4A1P11836 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms