Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPSAP08865 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPSAP08865 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPSAP08865 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPSAP08865 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPSAP08865 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPSAP08865 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPSAP08865 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms