Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPBP07199 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CENPBP07199 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPBP07199 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPBP07199 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPBP07199 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPBP07199 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms