Protein–RNA interactions for Protein: P01909

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1P01909 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQA1P01909 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms