Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms