Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms