Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEC24BO95487 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms