Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPO95166 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms