Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITX3O75364 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITX3O75364 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITX3O75364 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITX3O75364 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITX3O75364 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITX3O75364 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITX3O75364 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITX3O75364 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITX3O75364 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms