Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms