Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1BO43795 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms